В письме от 27.08.15 № 03-07-09/49478 Минфин напомнил, что счет-фактура подписывается руководителем и главным бухгалтером организации либо иными лицами, уполномоченными на то приказом (иным распорядительным документом) по организации или доверенностью от имени организации.

Пунктом 2 статьи 160 ГК предусмотрено, что использование при совершении сделок факсимильного воспроизведения подписи с помощью средств механического или иного копирования, электронной подписи либо иного аналога собственноручной подписи допускается в случаях и в порядке, предусмотренных законом, иными правовыми актами или соглашением сторон.

Использование счетов-фактур, подписанных факсимильной подписью, НК не предусмотрено. Счета-фактуры с факсимиле признаются составленными с нарушением установленного порядка и не могут являться основанием для принятия предъявленных покупателю продавцом сумм НДС к вычету.

В подтверждение Минфин приводит постановление президиума ВАС от 27.09.2011 N 4134/11. Другие суды, в основном, принимают аналогичные решения (например, определение ВС от 03.08.15 № 303-КГ15-8444, дела: № А57-8362/2013, № А57-4665/2013, № А79-13124/2012, №А42-3909/2012, № А72-7108/2012).

Однако необходимо добавить, что в некоторых случаях налогоплательщикам помогает специальное соглашение о факсимиле с контрагентом (дело № А21-9443/2014). На это же намекали суды в рамках дела А32-2968/2012 (в отсутствие такого документа решение было принято в пользу налоговой). Минфин, как видим, также приводит норму ГК, согласно которой соглашение сторон может сделать использование факсимиле допустимым.