В письме от 4 февраля 2013 г. N 03-11-11/50 Минфин напомнил, что в случае реализации ОС и НМА до истечения трех лет с момента учета на УСН расходов на их приобретение (сооружение и т.д.), налогоплательщик обязан пересчитать налоговую базу за весь период пользования такими основными средствами и нематериальными активами с момента их учета в составе расходов до даты реализации с учетом положений гл. 25 НК. А также уплатить дополнительную сумму налога и пени. В отношении ОС и НМА со сроком полезного использования свыше 15 лет это правило действует в случае реализации до истечения 10 лет с момента их приобретения.

Пересчет налоговой базы заключается в исключении стоимости таких ОС или НМА из состава расходов при УСН за все налоговые (отчетные) периоды, в которых эти расходы учитывались.

Ведомство указало, что при этом возможно учесть в расходах суммы амортизации, начисленные в отношении данных основных средств или НМА.