В письме от 29.12.12 № 03-07-11/563 Минфин напомнил, как быть с уплаченным продавцу по счетам-фактурам НДС, если товары или услуги приобретены в период применения УСН, но не реализованы или не использованы в производстве. Если организация перешла на общий режим, то НДС по таким товарам, используемым во время применения общего режима, принимается к вычету.
При этом период, в котором учитывается вычет, по мнению Минфина - первый налоговый период применения ОСН. Ведомство аргументирует это еще одним своим мнением - о том, что право на вычет по НДС возникает в том налоговом периоде, в котором оформлен счет-фактура, а не в том периоде, когда приобретенные товары использованы. Поэтому при переходе с УСН это должен быть первый налоговый период по НДС.