В письме от 25 августа 2017 г. N АС-4-15/16906@ ФНС сообщила, что законодательство не содержит запрета на подачу уточненных налоговых деклараций за соответствующий налоговый период в случае назначения, проведения или окончания выездной проверки данного периода.

Также отсутствует запрет на подачу уточненки и после принятия решения по результатам проверки. При этом налоговое законодательство не ограничивает налогоплательщика и сроком на представление уточненок.

Если иное не предусмотрено порядком заполнения налоговой декларации, при перерасчете налогоплательщиком сумм налога не учитываются результаты налоговых проверок, проведенных налоговым органом, за тот налоговый (отчетный) период, по которому налогоплательщиком производится перерасчет сумм налога.

В случае представления уточненки в карточке расчета с бюджетом (КРСБ) отражается разница к доплате или уменьшению по отношению только к предыдущей декларации (первичной или предыдущей уточненной) за соответствующий период, без учета результатов проверок по предыдущим декларациям.

При этом, если к моменту ввода уточненной декларации в КРСБ были проведены решения по камеральным проверкам по предыдущим декларациям, либо решения по выездным проверкам с учетом решений вышестоящих налоговых органов (судебных органов), в КРСБ проводится разница к доплате или уменьшению по отношению только к предыдущей декларации.

Специального порядка для уточненок по УСН не предусмотрено.

При этом при вынесении решения по результатам камеральной проверки уточненной декларации необходимо учитывать ранее начисленные суммы по выездной проверке.

Если налогоплательщик представил уточнеку за период, в котором были проведены доначисления по камеральным или выездным проверкам, то кроме истребования налоговым органом пояснений в соответствии с п. 3 ст. 88 НК, рекомендуется также запросить у налогоплательщика пояснения по факту отражения результатов налоговых проверок в этой декларации.

Если эти результаты учтены, то во избежание возникновения в КРСБ сумм необоснованной налоговой задолженности сторнирование сумм, отраженных в КРСБ по уточненнке, производится на основании служебной записки начальника отдела камеральных проверок.