В письме от 02.02.17 № 03-07-14/5451 Минфин напомнил, что организации на УСН не освобождаются от исполнения обязанностей налоговых агентов в отношении НДС. Налоговыми агентами они признаются в случаях, предусмотренных статьей 161 НК. Кроме того, в соответствии с пунктом 5 статьи 173 НК налог подлежит уплате в бюджет в случае выставления лицами, не являющимися налогоплательщиками НДС, в том числе применяющими УСН, счета-фактуры с выделением НДС. Также при УСН уплачивается "импортный" НДС и налог, возникающий в соответствии со статьей 174.1 НК.

В остальных случаях при УСН не уплачивается НДС. При передаче организацией, применяющей УСН, имущества участнику хозяйственного общества при выходе из этого общества НДС не исчисляется.