Если работники компании длительное время находятся в заграничной командировке и все свои трудовые обязанности, предусмотренные трудовым договором, выполняют в иностранном государстве, вознаграждение, которое они получают, относится к доходам, полученным от источников за пределами Российской Федерации. Ответ на вопрос — облагается ли такой доход налогом, зависит от  ответа на вопрос — признаются ли по итогам налогового периода сотрудники организации налоговыми резидентами РФ или нет.

Если работники компании не признаются налоговыми резидентами, НДФЛ не  уплачивается. В случае ошибочной уплаты НДФЛ Минфин в  письме от 05.05.12 №03-04-05/6-605 рекомендует произвести возврат налога в порядке, предусмотренном п. 1 ст. 231 НК РФ. То  есть вернуть налог должен налоговый агент по письменному заявлению работника.