В письме от 06.02.18 № 03-04-06/6908 Минфин рассмотрел такую ситуацию: рабочее место физлица – в филиале в Костромской области, а по совместительству этот же гражданин является и.о. директора филиала той же фирмы в Ивановской области. Оба филиала наделены полномочиями по начислению выплат в пользу физлиц. Вопрос возник по поводу того, в какой налоговый орган перечисляется НДФЛ, а в какой – взносы с зарплаты по договору совместительства, и куда сдается отчетность.

По общему правилу сумма НДФЛ, подлежащая уплате в бюджет по месту нахождения обособленного подразделения организации, определяется исходя из суммы дохода, подлежащего налогообложению, начисляемого и выплачиваемого работникам этого подразделения.

Сумма налога, исчисленного и удержанного с доходов работника двух обособленных подразделений организации, в одном из которых он работает по совместительству, должна быть перечислена в бюджет по месту нахождения каждого подразделения в отношении доходов, выплачиваемых данным подразделением. Аналогичным образом сдаются расчеты 6-НДФЛ.

Примерно то же самое относится и к страховым взносам.