В письме от 01.03.17 № 03-07-11/11467 Минфин напомнил, что согласно подпункту 15 пункта 3 статьи 149 НК операции займа в денежной форме, включая проценты по ним, освобождаются от НДС.

Налоговая база по НДС увеличивается на суммы, связанные с оплатой реализованных товаров (работ, услуг). Указанное положение не применяется в отношении операций по реализации товаров (работ, услуг), не подлежащих налогообложению НДС.

Таким образом, суммы комиссий за предоставление займа и пользование лимитом, получаемые заимодавцем от заемщика по договору займа в денежной форме, в налоговую базу по НДС заимодавцем не включаются, поскольку суммы таких комиссий по существу являются денежными средствами, связанными с оплатой услуг по предоставлению займа в денежной форме, освобождаемых от налогообложения НДС.