В октябре 2008 года между ООО "Д" (продавец) и ООО "С" (покупатель) был заключен предварительный договор купли-продажи доли в праве собственности на имущественный комплекс. В рамках договора в ноябре 2008 года покупателем был внесен аванс с формулировкой "без НДС".

В апреле 2010 года ООО "С" в одностороннем порядке расторгло договор и заявило о необходимости возврата аванса. В ходе выездной налоговой проверки ООО "Д" спорный аванс был признан подлежащим обложению НДС. Возврат аванса произведен в августе 2011 года. При этом уплата НДС в бюджет с полученного аванса была произведена налогоплательщиком только в октябре 2011 года и в августе 2012 года. 

ООО "Д" присоединено к ООО "С" в мае 2012 года. В октябре 2012 года ООО "С", являясь правоприемником ООО "Д", представило в инспекцию уточненную декларацию по НДС за 4 квартал 2011 года и 3 квартал 2012 года, в которых заявило вычет по возврату аванса в связи с расторжением договора.

По результатам камеральных налоговых проверок инспекция отказала в вычетах и доначислила пени, указав на пункт 4 статьи 172 НК, в соответствии с которым вычеты налога производятся после отражения операций по корректировке в связи с возвратом товаров или отказом от них, но не позднее одного года с момента возврата или отказа. Исходя из пункта 5 статьи 171 НК этот же порядок применяется и в случае возврата аванса.

Суд первой инстанции (дело № А12-5746/2014, А12-2010/2014) отменил решение инспекции, посчитав, что условия возмещения НДС были соблюдены. Апелляция и кассация не согласились с выводами суда, признав решение инспекции законным.

В данном случае указанный годичный срок исчисляется с момента составления уведомления о расторжении предварительного договора (апрель 2010 года), то есть с момента более раннего, чем возвращаемый НДС с аванса был уплачен в бюджет, и чем аванс возвращен покупателю. Соответственно, на момент декларирования вычета срок был пропущен.

Суды отмечают, что обязанность по перечислению НДС с суммы аванса возникла у ООО "Д" еще в последнем квартале 2008 года. При этом ООО "Д" было вправе при своевременном исполнении своих налоговых обязательств применить налоговый вычет с аванса.