В письме от 21 марта 2014 года N 03-11-11/12308 Минфин напомнил условия, при которых ИП, применяющий ПСН, утрачивает на нее право. Это, в частности, неоплата очередной части стоимости патента. Такой ИП считается применявшим общий режим налогообложения с момента начала действия патента, а следовательно - и налогоплательщиком НДС.

ИП, применяющий ПСН, освобождается от уплаты пеней только в отношении авансовых платежей по налогам, подлежащим уплате в соответствии с общим режимом налогообложения в течение того периода, на который был выдан патент. Уплата авансовых платежей по НДС Налоговым кодексом не предусмотрена.

Следовательно, при утрате права на ПСН индивидуальный предприниматель обязан начислять пени на суммы НДС, подлежащие уплате в периоде, на который был выдай патент.