В письме от 6 декабря 2013 г. N 03-11-06/2/53306 Минфин напомнил, что к вычету принимается НДС в случае использования предмета покупки, по которому этот НДС предъявлен, в операциях, облагаемых НДС.

Поэтому сумма НДС, предъявленная организации при приобретении недвижимого имущества, предназначенного для использования после перехода на УСН, вычету не подлежит.