Налогоплательщик (ЗАО "Лаборатория Касперского") пытался обжаловать в Конституционном суде конституционность ряда норм, регламентирующих учет входящего НДС. Компания осуществляет передачу авторских прав за пределами территории РФ, в связи с чем по этой реализации не возникает объекта налогообложения НДС, часть - облагается НДС в общем порядке. При этом по общехозяйственным расходам компания не вправе принять к вычету входящий НДС в полном объеме. Приходится вести раздельный учет, поскольку по облагаемым НДС операциям входной НДС предъявляется к вычету, а по тем, местом реализации которых не является территория РФ, - учитывается в составе расходов вместе со стоимостью приобретаемых товаров и услуг. Попытка принять к вычету весь этот НДС и отсутствие раздельного учета привело к привлечению компании к налоговой ответственности, которое в конечном итоге не удалось отменить в рамках арбитражного судопроизводства.

Определением от 4 июня 2013 г. N 966-О КС отказал в принятии к рассмотрению жалобы компании. В документе указано, в частности: "федеральный законодатель прямо предусмотрел, что суммы "входного" налога по операциям, местом реализации которых не признается территория РФ, подлежат отнесению на затраты по производству и реализации товаров (работ, услуг), и, соответственно, они уменьшают другой налог - налог на прибыль организаций. Поскольку применение данного компенсаторного механизма предполагает ведение налогоплательщиком раздельного учета сумм налога, такой учет становится обязательным, в том числе в связи с осуществлением названных операций. Следовательно, оспариваемые заявителем положения НК РФ не могут рассматриваться как неопределенные и нарушающие конституционные права заявителя в указанном им аспекте".