В письме от 20 мая 2013 г. N 03-11-11/17542 Минфин указал на некоторые аспекты применения патентной системы налогообложения, в частности, ее совмещения с УСН.

Если ИП совмещал УСН и ПСН и утратил право на патент по одному из оснований, предусмотренных п. 6 ст. 346.45 НК, такой предприниматель за период, в котором утрачено право на ПСН, обязан уплатить налоги в рамках общего режима налогообложения, от которых он был освобожден в соответствии с пунктами 10 и 11 ст. 346.43 НК. Все упомянутые здесь нормы - основания для утраты право на спецрежим, основания для освобождения от налогов в рамках общего режима - касаются ПСН.

Получается, что ИП, утративший право на ПСН, но не утративший право на "упрощенку", должен совмещать УСН и общий режим налогообложения.