В письме от 09.11.17 № 03-07-11/73708 Минфин напомнил, то суммы НДС, предъявленные налогоплательщику при приобретении на территории РФ товаров (работ, услуг), подлежат вычетам в случае приобретения этих товаров (работ, услуг) для операций, облагаемых НДС, после принятия на учет и при наличии счетов-фактур.

В соответствии с пунктом 1.1 статьи 172 НК указанные вычеты могут быть заявлены в налоговых периодах в пределах трех лет после принятия на учет приобретенных товаров (работ, услуг).

В то же время, согласно пункту 1 статьи 172 НК вычеты НДС при приобретении основных средств, оборудования к установке и (или) нематериальных активов производятся после принятия на учет данных ОС, оборудования, НМА в полном объеме.

Таким образом, не предусмотрен вычет НДС на основании одного счета-фактуры частями в разных налоговых периодах в течение трех лет после принятия на учет ОС или НМА, считает Минфин.