В письме от 24.10.17 № 03-07-08/69626 Минфин напомнил, что "импортный" НДС подлежит вычету в случае использования товаров для операций, облагаемых НДС, после принятия товаров на учет и при наличии документов, подтверждающих ввоз и уплату налога.
Подпунктам "е" и "к" пункта 6 правил ведения книги покупок (постановление 1137), предусмотрено, что в графе 3 "Номер и дата счета-фактуры продавца" указываются регистрационный номер таможенной декларации либо несколько таких номеров через ";" (точку с запятой), а в графе 7 "Номер и дата документа, подтверждающего уплату налога" - номер и дата документа, подтверждающего фактическую уплату налога таможенному органу.
Таким образом, суммы НДС, уплаченные таможенным органам по ввезенным из ЕС товарам, подлежат вычету после принятия товаров на учет на основании документов, подтверждающих уплату налога, а также таможенных деклараций, подтверждающих ввоз, при условии использования данных товаров в операциях, облагаемых НДС. Поэтому отсутствие оригиналов транспортных документов, подтверждающих перемещение указанных товаров через границу, в том числе оригиналов международной транспортной накладной (CMR), не может являться основанием для отказа в вычете.
CMR является документом, установленным Конвенцией о договоре международной дорожной перевозки грузов (КДПГ), заключенной в г. Женеве 19 мая 1956 года. CMR подтверждает факт перевозки груза и расходы, понесенные в связи с этой операцией. При исчислении налога на прибыль не учитываются расходы на перевозку товаров, которые документально не подтверждены, напомнило ведомство.

