В письме от 30.08.16 № 03-07-11/50432 Минфин указал, что статья 78 НК не ограничивает проведение зачета суммы излишне уплаченного федерального налога в счет погашения недоимки по другому федеральному налогу. Вместе с тем, пунктом 9 статьи 226 НК установлен запрет уплаты НДФЛ за счет средств налогового агента.

Этим письмом ведомство отвечало на вопрос о возможности зачета переплаты по НДС в счет недоимки по НДФЛ.

Таким образом, теперь позиция ведомства по подобным вопросам менее ясна, чем полгода назад, когда оно однозначно высказало мнение о возможности зачета излишне уплаченного налога на прибыль в счет задолженности по НДФЛ.