В письме от 30.06.16 № 03-04-05/38368 Минфин напомнил, что в случае выхода участника из ООО его доля переходит к ООО. Оно обязано выплатить участнику, подавшему заявление о выходе, действительную стоимость его доли в уставном капитале, определяемую на основании данных бухгалтерской отчетности за последний отчетный период, предшествующий дню подачи заявления, или с согласия этого участника выдать ему в натуре имущество такой же стоимости.
Денежные средства выплачиваются участнику за счет уменьшения имущества ООО, то есть имущества, являющегося собственностью самого ООО, а не его участников.
Для доходов, облагаемых НДФЛ по налоговой ставке 13% (включая упомянутый вид дохода), налоговая база определяется как денежное выражение таких доходов, подлежащих налогообложению, уменьшенных на сумму налоговых вычетов, предусмотренных статьями 218 - 221 НК.