В письме от 11.03.2015 № 03-07-11/12694 Минфин указал, что при приобретении услуг по перевозке работников к месту служебной командировки и обратно в книге покупок регистрируются заполненные в установленном порядке бланки строгой отчетности или их копии с выделенной отдельной строкой суммой НДС, выданные работнику и включенные им в отчет о служебной командировке.

Это делается на основании пункта 18 Правил ведения книги покупок, утвержденных постановлением правительства РФ от 26 декабря 2011 года № 1137.

Минфин и в других подобных письмах (о подтверждении НДС со стоимости проезда и проживания в гостинице командированных) высказывал аналогичное мнение.При этом как в постановлении 1137, так и в письмах упоминаются некие "отчеты о командировке" без уточнения, идет ли речь об авансовых отчетах.