Налогоплательщик заказал у подрядчика работы по НИОКР, осуществляемые с 2010 по 2012 гг. (включительно), которые с 1 января 2012 г. добавлены в перечень НИОКР, расходы на которые учитываются в прочих расходах в размере фактических затрат с применением коэффициента 1,5. Налогоплательщик не учитывал для целей налогообложения прибыли понесенные расходы на НИОКР (по результатам выполненных и сданных этапов) до момента формирования нематериального актива.

С 1 января 2012 года вступила в силу норма НК, что если НИОКР привели к созданию НМА, то он может подлежать амортизации, либо, по выбору налогоплательщика, расходы на такие НИОКР учитываются в составе прочих расходов, связанных с производством и реализацией, в течение двух лет. Выбранный порядок отражается в учетной политике. До этого затраты на НИОКР, по которым получены исключительные права, не было возможности учитывать в прочих расходах (можно было только амортизировать НМА).

В состав прочих расходов с коэффициентом 1,5 затраты включаются в том отчетном (налоговом) периоде, в котором завершены такие исследования или разработки (отдельные этапы работ).

В письме от 29 марта 2013 г. N 03-03-06/1/10093 Минфин сообщил, что в феврале 2012 года в перечень НИОКР, расходы налогоплательщика на которые включаются в состав прочих расходов в размере фактических затрат с коэффициентом 1,5, были внесены дополнения. Эти дополнения вступили в силу с 1 января 2012 года, то есть задним числом.

Минфин высказал мнение о формировании первоначальной стоимости НМА по завершенным и включенным в перечень в 2012 году НИОКР:

"Если в результате произведенных в 2010 - 2012 гг. расходов на НИОКР, включенных с 1 января 2012 г. в перечень НИОКР, установленный постановлением Правительства ... от 24.12.2008 N 988, налогоплательщик получает исключительные права на результаты интеллектуальной деятельности, то первоначальная стоимость такого нематериального актива формируется исходя из фактических затрат, определенных на момент завершения отдельных этапов работ в 2010 - 2011 гг., без применения коэффициента 1,5 в порядке, действовавшем в 2010 - 2011 гг., и из фактических затрат, определенных на момент завершения отдельных этапов работ в 2012 г., с применением коэффициента 1,5".