В письме от 20.03.13 № АС-4-3/4811 ФНС напомнила о порядке возмещения НДС из бюджета по итогам камеральной проверки, а также о возможности налогоплательщика подать уточненную налоговую декларацию по НДС. Если в ранее представленной декларации ошибки не привели к уменьшению уплачиваемого в бюджет (или к увеличению возмещаемого) налога, то представить уточненку - это право налогоплательщика, а если привели - то обязанность.
В общем случае право на возмещение налога сохраняется, если уточненная декларация подана в пределах трехлетнего срока после окончания налогового периода.
ФНС указала на еще один вариант, когда налоговики не будут отказывать в возмещении, если уточненная декларация подана позднее, чем истекли три года с момента окончания налогового периода, за который она подается. В этом случае уточненка должна быть второй по счету, и вычеты, которые заявлены в ней, должны были быть отражены и в первой уточненке, поданной в пределах трехлетнего срока. То есть налоговые вычеты, отраженные в обеих уточненных налоговых декларациях, не изменились.
Формулируя это, ФНС учла сложившуюся арбитражную практику.