В письме от 21.07.17 № 03-04-06/46690 Минфин разъяснил, что хотя налоговый статус физлица устанавливается на каждую дату выплаты дохода, окончательный налоговый статус определяется по окончании налогового периода.

Из этого следует, что при заполнении формы 2-НДФЛ в поле "Статус налогоплательщика" указывается та цифра, которая соответствует налоговому статусу налогоплательщика по окончании налогового периода.

При этом в поле "Сумма дохода" раздела 3 формы 2-НДФЛ отражается вся сумма начисленного и фактически полученного дохода по соответствующему коду дохода независимо от применявшейся налоговым агентом налоговой ставки при удержании исчисленных сумм налога при каждой выплате дохода, в поле "Сумма налога исчисленная" раздела 5 формы 2-НДФЛ указывается сумма налога, исчисленная в соответствии с окончательным налоговым статусом налогоплательщика, а в поле "Сумма налога удержанная" раздела 5 формы 2-НДФЛ указывается общая сумма налога, фактически удержанная налоговым агентом исходя из налогового статуса налогоплательщика, определяемого при каждой выплате дохода.

Если изложенное не понятно, Минфин рекомендует обратиться в ФНС.