Компания занимается освоением природных ресурсов. В рамках этой деятельности во 2 и 4 кварталах 2011 года ею приобретена геологическая информация, отчет о характеристиках месторождения, которые в соответствии с ПБУ 24/2011 признаются нематериальными поисковыми активами. В этих же периодах налогоплательщиком получены счета-фактуры, и объект принят к учету на счете 08 «Вложение во внеоборотные активы». К учету на счете 04 «нематериальные активы» объект был принят в 2015 году.

Компания заявила вычеты в декларации по НДС за 2 квартал 2015 года.

По результатам камеральной проверки ИФНС отказала в вычете, указав на пропуск трехлетнего срока для применения вычетов.

Компания оспорила решение в суде (дело № А40-117021/2016), полагая, что право на вычет возникает после принятия на учет нематериального актива. По мнению компании, трехлетний срок на применение налоговых вычетов необходимо исчислять с момента подтверждения коммерческой целесообразности приобретенных НМА, то есть с 11 октября 2013 года. Оснований для принятия вычета до указанной даты не имелось, поскольку не было известно, будет ли актив использоваться в производственной деятельности - для совершения операций, облагаемых НДС.

Суды трех инстанций отказали в удовлетворении требований, указав, что все условия для вычета, предусмотренные статьями 171, 172 НК и ПБУ 24/2011, были соблюдены в 2011 году. Таким образом, трехлетний срок начинает течь со 2 и 4 кварталов 2011 года (периоды получения НМА и счетов-фактур), в этих периодах у налогоплательщика возникает право на вычет. НК не ставит право на вычет в зависимость от того, на каком счете бухучета учтены приобретенные товары (работы, услуги). Также законодательство не связывает право на вычет с подтверждением коммерческой целесообразности нематериальных поисковых активов, указала кассация (Ф05-22466/2016 от 03.02.2017).