В 4 квартале 2010 года компания ошибочно увеличила налоговую базу по НДС на 48 млн рублей, во 2 квартале 2011 года исправила эту ошибку, заявив вычет в налоговой декларации по НДС. По результатам выездной проверки ИФНС отказала в этом вычете, доначислила НДС, пени и штраф, полагая, что ошибка должна быть исправлена уменьшением налоговой базы.

Суды трех инстанций (дело № А19-10686/2015) отменили решение инспекции, указав на положения статей 54, 171, 172 НК - заявление вычета спорной суммы в более поздний период – во 2 квартале 2011 года (в периоде выявления ошибки) - не противоречит налоговому законодательству и не привело к возникновению задолженности. Компания правомерно исправила ошибку спустя два квартала. Отражение вычетов, а не уменьшения налоговой базы, не повлекло искажения итоговой суммы налога и каких-либо потерь для бюджета.

Суды (постановление кассации Ф02-1892/2016 от 17.06.2016) отметили, что, отказывая в применении вычета, инспекция не откорректировала налоговую базу, из-за чего необоснованно завышена суммарная задолженность.