В письме от 1 апреля 2014 г. N 03-07-РЗ/14415 Минфин рассмотрел вопрос о восстановлении НДС по зданию, введенному в эксплуатацию в 1998 году.
Порядок восстановления принятых к вычету сумм НДС по объектам недвижимости, предусмотренный п. 6 ст. 171 НК вступил в силу с 01.01.2006. В связи с этим указанный порядок применяется в отношении объектов недвижимости, по которым начисление амортизации производилось начиная с 01.01.2006.
Если объект недвижимости введен в эксплуатацию в 1998 году, то при дальнейшем его использовании в операциях, не облагаемых НДС, ранее принятые к вычету суммы НДС подлежат восстановлению в размере суммы, пропорциональной остаточной (балансовой) стоимости без учета переоценки.