В письме от 11.04.2013 № 03-11-10/12043  Минфин разъяснил, с какого момента компания должна начать облагать свои доходы в рамках общего режима, если получила лицензию на пользование участками недр, предоставляющую право разведки и добычи полезных ископаемых.

Права и обязанности пользователя недр возникают с даты госрегистрации такой лицензии, а при предоставлении права пользования участком недр на условиях соглашения о разделе продукции - с даты вступления такого соглашения в силу.

Таким образом, в рассматриваемом случае организация утрачивает право на УСН с начала квартала, в котором была произведена государственная регистрация лицензии.