В письме от 30.04.2013 № 03-07-11/15419 Минфин ответил на вопрос, как продавцу товаров, использующему многооборотную тару, применять вычеты по входному НДС при ее приобретении.

Если тара, в которой реализуются товары, облагаемые НДС, подлежит возврату продавцу товаров, то НДС, уплаченный продавцом при ее приобретении, к вычету не принимается. В случае невозврата тары покупателями продавцу товаров вычет налога, уплаченного продавцом поставщикам тары, осуществляется в общеустановленном порядке.