Переплату по НДС нельзя зачесть в счет недоимки по налогу на имущество физлиц. Дело в том, что порядок, предусмотренный Налоговым кодексом разрешает зачитывать суммы излишне уплаченных налогов по соответствующим видам платежей. А согласно статьям 13 и 15 Налогового кодекса НДС относится к федеральным налогам, а налог на имущество физических лиц - к местным.

На этом основании Минфин России в письме от 13.12.2011 г. № 03-05-06-01/86 разъяснил, что зачесть переплату по одному из этих налогов в счет другого нельзя.