Учреждение попало в налоговую ловушку. В ситуации, когда учреждение с согласия собственника сдает в аренду помещения, находящиеся в федеральной собственности возникает большой вопрос с уплатой налога на прибыль и НДС.

Суд признал правомерным доначисление налога на прибыль, но отменил начисленные пени и штраф. В Постановлении КС №10-П был сделан вывод об отсутствии законно установленного порядка исполнения государственными учреждениями обязанности по уплате налога на прибыль с доходов от сдачи в аренду переданного им в оперативное управление федерального имущества. На этом основании суд указал, что имеется препятствие для учреждений самостоятельно уплатить этот налог в федеральный бюджет.

Постановление ФАС Восточно-Сибирского округа от 15 декабря 2009 г. N А19-13933/08