В письме 02.09.2008 г. № 03-11-04/2/130 специалисты Минфина России потребовали, чтобы на суммы переплаты по налогу на прибыль и НДС, полученные из бюджета, компания начислила налог. Специалисты главного финансового ведомства отвечали на запрос компании, применяющей «упрощенку». Тем не менее, напрашивается вывод, что свое заключение они распространяют и на компании, находящиеся на общем режиме, отмечают «Документы и комментарии». Ведь обоснование позиции, изложенной в письме, базируется на толковании норм главы 25 «Налог на прибыль» НК РФ, а именно статьи 251 НК РФ.

По мнению редакции журнала, позиция Минфина России не соответствует как положениям главы 25 «Налог на прибыль» НК РФ, так и основополагающим принципам, закрепленным в части I НК РФ. По мнению Олега Хорошего, руководителя Управления ФНС России по Челябинской , к ошибочному заключению специалистов Минфина привело противоречие, заложенное в самом Налоговом кодексе.