На данное обстоятельство обратил внимание ФАС Западно-Сибирского округа в Постановлении № А67-896/2011 от 24.01.2012 где судьи признали, что право на применение налоговых вычетов возникает у лица только после отражения в налоговой декларации. В обоснование своей позиции суд пояснил, что применение налоговых вычетов по НДС является правом общества. Оно носит заявительный характер посредством их декларирования в подаваемых в инспекцию налоговых декларациях и может быть реализовано только при соблюдении установленных в НК РФ условий.

Само по себе наличие у общества первичных бухгалтерских документов, подтверждающих, право на применение налогового вычета, без отражения (указания, заявления) суммы налогового вычета в налоговой декларации, не является основанием для уменьшения подлежащего уплате в бюджет по итогам налогового периода НДС. При этом недекларирование налоговых вычетов и непредставление инспекции в ходе налоговой проверки документов, подтверждающих данные вычеты, не лишает налогоплательщиков права на их применение в последующем при соблюдении условий, установленных НК РФ.

Источник: УФНС - Смоленская область