В письме от 21 февраля 2018 г. N ЕД-4-15/3540@ ФНС ответила на вопрос об администрировании акцизов по обособленным подразделениям налогоплательщиков, относящихся к категории крупнейших.
Крупнейшие налогоплательщики ставят на учет в "рядовых" налоговых органах обособленные подразделения, также становятся на учет по месту нахождения недвижимости и транспортных средств и по иным основаниям. В этом случае инспекция, поставившая на учет крупнейшего налогоплательщика по указанным основаниям, не позднее следующего рабочего дня после выдачи уведомления о постановке на учет направляет сведения об этом в инспекцию по месту нахождения организации. Эта инспекция не позднее следующего рабочего дня направляет указанные сведения в межрегиональную (межрайонную) инспекцию по крупнейшим налогоплательщикам.
Декларации по акцизам подаются вобщем случае по месту нахождения организации, а также по месту нахождения каждого обособленного подразделения. Налогоплательщики, в соответствии со статьей 83 НК, отнесенные к категории крупнейших, представляют все декларации в налоговый орган по месту учета в качестве крупнейших налогоплательщиков. В том числе это касается отчетности по установленным форматам в электронной форме.
Крупнейшие налогоплательщики представляют все налоговые декларации по акцизам в налоговый орган по месту учета в качестве крупнейшего налогоплательщика. При этом декларации, представленные организацией по обособленным подразделениям, этот орган перенаправляет в налоговые органы по месту нахождения подразделений.
Также ФНС отметила, что по отдельным налогоплательщикам принято решение о закрытии карточек "РСБ" по месту нахождения обособленных подразделений и передаче пакета документов, необходимого для администрирования подразделений, в налоговый орган по месту учета в качестве крупнейшего налогоплательщика.