В письме от 19.09.17 № БС-4-21/18669 ФНС сообщила, что для целей налогообложения местом нахождения наземных транспортных средств организации признается место нахождения организации (ее обособленного подразделения).
Регистрация транспортных средств за юрлицами производится по месту их нахождения, определяемому местом их госрегистрации, либо по месту нахождения их обособленных подразделений.
Налогоплательщики-организации по истечении налогового периода представляют в налоговый орган по месту нахождения транспортных средств налоговую декларацию по транспортному налогу. Транспортный налог подлежит уплате налогоплательщиками в бюджет по месту нахождения транспортных средств.
Таким образом, организации, на которых зарегистрированы транспортные средства, представляют декларацию и платят транспортный налог в бюджет субъекта РФ по месту нахождения транспортных средств, указанному в уведомлении о постановке на учет российской организации в налоговом органе.