В определении № ВАС-7239/09 судьи уточнили, как следует применять абзац 2 пункта 5 статьи 89 Налогового кодекса РФ, в котором сказано, что налоговики не вправе проводить более двух выездных проверок в течение календарного года. Исключение — случаи, когда решение о проверке сверх лимита принимает ФНС России.

Зачастую инспекторы понимают указанное правило так: руководитель ИФНС не имеет права принимать решения о проведении выездных проверок чаще двух раз в год. То есть налоговики обычно ориентируются на то, сколько контрольных мероприятий инспекция уже назначила в текущем году. Те же проверки, которые фактически были проведены, но назначены в предыдущие годы, в расчет не берутся.

Однако, как отметили в определении судьи ВАС РФ, этот подход неверен. И, применяя правила пункта 5 статьи 89 кодекса, необходимо определять, сколько выездных проверок инспекция фактически проводила. При этом не важно, каким годом — этим или предыдущим — датированы решения ИФНС.