Если в результате уплаты обособленным подразделением налога образовалась переплата, а впоследствии подразделение ликвидировали, то возврат излишне уплаченных сумм налога получит сама организация – по месту своего учета. Даже если подразделение находилось в другом регионе.
Инспекторы не соглашались с таким выводом, поясняя, что решения о возврате налога должны принимать территориальные налоговые органы. Кроме того, инспекция не может нести ответственность за невозврат налога другими налоговыми органами.
Однако судьи не сочли эти аргументы весомыми (постановление ФАС Московского округа от 2 сентября 2008 г. № А40-63118/07-99-279). Налогоплательщиком является организация, а не ее подразделение, даже ликвидированное. А требования о подаче отдельного заявления о возврате в отношении ликвидированного обособленного подразделения в НК РФ не содержится.