В письме от 21.01.16 № 03-05-06-03/2076 Минфин указал, что уплаченная госпошлина подлежит возврату частично или полностью в случае уплаты в большем размере, чем это предусмотрено.

Госпошлина подлежит возврату в случае отказа лиц, уплативших ее, от совершения юридически значимого действия до обращения в уполномоченный орган (к должностному лицу), совершающий (совершающему) данное действие.

Таким образом, в случае отказа уполномоченного органа соискателю лицензии в ее переоформлении возврат или зачет госпошлины, уплаченной за переоформление данной лицензии, не производится.

Следовательно, при повторном обращении за переоформлением лицензии должна быть уплачена госпошлина в установленном размере.