Письмом от 28.06.2018 N СД-4-3/12477@ ФНС направила письма Минфина от 24.05.2018 N 03-07-15/34977 и от 21.05.2018 N 03-07-07/34009 о вычете сумм НДС, уплаченных при ввозе товара на территорию РФ по ставке 18%, если при реализации НДС исчислен по ставке 10%.

В отношении ввозимых и реализуемых товаров применяется пониженная ставка НДС 10%, если коды видов данных товаров в соответствии с ТН ВЭД ЕАЭС и ОКПД2 предусмотрены постановлением правительства от 15 сентября 2008 г. N 688, товары (в данном случае - препараты) зарегистрированы, по ним имеется регистрационное удостоверение, и они включены в государственный реестр лекарственных средств.

В то же время до 2016 года при ввозе в РФ лекарственных средств ветеринарного назначения таможенные органы взимали НДС по ставке 18%.

Ввозной НДС подлежит вычетам в случае использования товаров для операций, облагаемых НДС, после принятия их на учет и при наличии документов, подтверждающих фактическую уплату налога при ввозе товаров.

Так что НДС, уплаченный до 2016 года при ввозе указанных препаратов по ставке 18%, принимаются к вычету в полном объеме, несмотря на то, что при их реализации в РФ применяется ставка 10%.