В письме от 21.05.18 № ЕД-4-15/9591@ ФНС разъяснила последствия неотражения налогоплательщиком в книге продаж в составе декларации по НДС счетов-фактур, указанных в требовании налогового органа о представлении пояснений.

При обнаружении налогоплательщиком неполноты отражения сведений, ошибок, приводящих к занижению суммы налога, надо представить в налоговый орган уточненку.

Если камеральной проверкой выявлены ошибки в декларации, противоречия между представленными документами или несоответствие сведений, представленных налогоплательщиком, сведениям, имеющимся у налогового органа, об этом сообщается налогоплательщику с требованием предоставить в течение пяти дней пояснения или внести исправления.

Так что в случае выявления налогоплательщиком по результатам анализа требования о представлении пояснений факта невключения счетов-фактур в раздел 9 декларации по НДС он обязан внести исправления и представить уточненку.