В письме от 17.05.18 № БС-4-11/9425 ФНС ответила, вправе ли налоговики в ходе камералки направлять налоговому агенту запросы о подтверждении сумм дохода и удержанного НДФЛ, отраженных в 2-НДФЛ, если таких сведений нет в федеральных информационных ресурсах налоговых органов.

Камеральная проверка проводится на основе налоговых деклараций (расчетов) и документов, представленных налогоплательщиком, а также других документов о деятельности налогоплательщика, имеющихся у налогового органа.

При этом пунктом 1 статьи 93.1 НК установлено, что должностное лицо налогового органа, проводящее проверку, вправе истребовать у различных лиц, располагающих документами (информацией), касающимися деятельности проверяемого налогоплательщика, эти документы (информацию).

Так что если налоговая камералит декларацию 3-НДФЛ, а в базах налоговых органов нет сведений о доходах физлица, то должностное лицо налогового органа вправе истребовать у налогового агента подтверждение сумм дохода и удержанного налога.