ЗАО применяло общую систему налогообложения, а с 1 января 2016 года перешло на УСН. В апреле 2015 года, то есть до перехода на УСН, компания подала заявление-уведомление о начале процедуры реорганизации в форме выделения АО, которое в сентябре 2015 года поставлено на налоговый учет и с момента создания применяет УСН. Учредителем АО является ЗАО. АО было передано имущество, по которому ЗАО заявляло вычеты НДС в 2012-2015 годах. Однако по разделительному балансу возмещенный НДС (обязанность по восстановлению) АО не передавался.
По результатам камеральной проверки декларации по НДС, представленной ЗАО, налоговая доначислила НДС, пени и штраф.
Суды трех инстанций (дело № А27-15970/2016) признали законным решение инспекции, указав, что при переходе с общей системы на УСН суммы налога, принятые к вычету, подлежат восстановлению в налоговом периоде, предшествующем переходу на УСН. Восстановлению подлежат суммы налога в размере, пропорциональном остаточной стоимости без учета переоценки.
Ранее принятый к вычету НДС по имуществу, которое в последующем передано при реорганизации, «остался» у налогоплательщика (ЗАО), и при переходе на УСН такой НДС в силу пункта 3 статьи 170 НК подлежит восстановлению в бюджет именно данным налогоплательщиком.
Суды (Ф04-1879/2017 от 20.06.2017) отклонили довод компании об отсутствии имущества, указав, что НК не освобождает налогоплательщика от восстановления НДС при переходе на УСН исключительно по мотиву того, что перед переходом на УСН компания провела реорганизацию.