В 2011-2013 годах компания применяла два режима налогообложения: по общей системе (оптовая торговля) и ЕНВД (розничная торговля). Приобретенные товары использовались в операциях, облагаемых НДС и необлагаемых НДС. Согласно учетной политике компании сначала весь НДС по приобретенным товарам принимался к вычету, а затем в случае дальнейшего использования их для операций, не подлежащих налогообложению НДС, восстанавливался.
По результатам выездной проверки налоговая доначислила НДС, пени и штраф, указав на неправомерность вышеуказанной методики. При этом факт принятия к вычету НДС в полном объеме по товарам, приобретенным для реализации через оптовую и розничную торговлю, подтверждается счетами-фактурами, книгами покупок, налоговыми декларациями.
Суды трех инстанций (дело № А03-19439/2015) признали законным решение инспекции, указав на положения пункта 7 статьи 346.26 НК, обязывающего при совмещении деятельности по ЕНВД с другой деятельностью вести раздельный учет. При этом налогоплательщик должен организовать налоговый и бухгалтерский учет так, чтобы можно было однозначно определить, к какому виду деятельности относятся те или иные суммы "входящего" налога.
В решении кассации (Ф04-5863/2016 от 19.01.2016) указано: "Налоговым кодексом РФ не предусмотрено право налогоплательщика предъявлять к вычету часть налога, относящуюся к операциям по реализации товара (работ, услуг), которые не подлежат налогообложению".
О как!...
1) Брали вычет, даже по заведомо товарам на ЕНВД, с востановлением в следующем периоде.
2) грязно оформляли - "сведения о восстановленных суммах НДС, отраженные обществом в «реестрах счетов-фактур по распределительному учету» не зарегистрированы в книге продаж налогоплательщика".
За что и получили.
На самом деле ситуация не столь однозначна. Например, в негосударственном мед.учреждении есть лечебный процесс (необлагаемый по НДС) и есть аптечный пункт этого же учреждения, где часть медикаментов и/или сан-мед. аксессуаров облагается, а часть не облагается. И тогда, перчатки резиновые (или марлевые маски), закупленные партией и оприходованные на склад могут быть в непредсказуемом порядке реализованы через аптеку, а могут быть использованы в лечебном процессе.
Соответственно, НДС придется восстанавливать для тех предметов, которые будут направлены в лечебный процесс.
Похожая ситуация в образовательных учреждениях: есть сопутствующие направления деятельности, которые подлежат обложению, и есть основной необлагаемый учебный процесс, ТМЦ приобретаются партиями и в какой части деятельности они будут использованы - заведомо не известно...