В письме от 01.12.16 № 03-07-11/71110 Минфин напомнил о необходимости восстановления НДС, принятого к вычету по основным средствам, используемым в необлагаемых НДС операциях, а также в операциях, производимых лицами, не являющимися плательщиками НДС. При этом исключение составляют объекты ОС, которые полностью самортизированы или с момента ввода которых в эксплуатацию у такого налогоплательщика прошло не менее 15 лет.
Налогоплательщик обязан отражать восстановленную сумму налога в декларации за последний налоговый период каждого календарного года из десяти лет начиная с года, в котором наступили соответствующие обстоятельства.
Расчет суммы налога, подлежащей восстановлению и уплате в бюджет, производится исходя из одной десятой суммы налога, принятой к вычету, в соответствующей доле - в доле операций, не облагаемых НДС, в общей стоимости товаров (работ, услуг), имущественных прав, отгруженных (переданных) за соответствующий календарный год. При этом сумма НДС, подлежащая восстановлению, в стоимость данного имущества не включается, а учитывается в составе прочих расходов в соответствии со статьей 264 НК.
Суммы налога, предъявленные налогоплательщику при приобретении по договору купли-продажи недвижимости (основного средства), принимаются к вычету в полном объеме вне зависимости от того, что данное имущество предназначено для использования одновременно в операциях, облагаемых НДС, освобождаемых от НДС, и в деятельности, облагаемой ЕНВД. После ввода таких объектов в эксплуатацию суммы налога, принятые к вычету, подлежат восстановлению и уплате в бюджет в течение 10 лет в изложенном выше порядке.