В 2014 году ИФНС принято решение о проведении выездной проверки в отношении компании за 2011-2013 годы. По результатам проверки инспекция выявила недоимку по НДС за 1 - 4 кварталы 2011 и 1 квартал 2012 года.

Суд первой инстанции (дело № А40-16196/2016) отменил решение, указав на пропуск сроков взыскания недоимки на дату вынесения решения по проверке. Согласно подпункту 4 пункта 1 статьи 109, пункту 1 статьи 113 НК лицо не может быть привлечено к ответственности, если с момента правонарушения до вынесения решения истекли три года.

Апелляция отменила решение суда. Налоговая проверка может охватывать не более, чем 3 календарных года, предшествующих году проведения проверки. В данном случае решение о проверке принято в 2014 году, то есть налоги могут быть доначислены за 2011, 2012, 2013 годы. При этом недоимка по налогу не является мерой ответственности и не может рассматриваться в качестве санкции, следовательно, трехгодичный срок, указанный в статье 113 НК, к недоимке по налогу не применим.

Решение по итогам выездной проверки вынесено 27 августа 2015 года. К ответственности за неуплату НДС за периоды 1 - 4 кварталы 2011 и 1 квартал 2012 компания не привлечена в связи с истечением трехлетнего срока.

В решении кассации (Ф05-15616/2016 от 01.11.2016) указано: «отказ в привлечении к налоговой ответственности по п. 1 ст. 122 НК РФ в связи с истечением срока давности, установленного ст. 113 НК РФ, не влияет на обязанность налогоплательщика уплатить сумму недоимки и соответствующие пени».