Компания занималась розничной торговлей, применяя ЕНВД.
По результатам выездной проверки за 2011-2012 годы ИФНС установила, что компания занималась также сдачей в аренду нежилых помещений. Инспекция доначислила налог на прибыль, НДС, пени и штраф.
Компания оспорила решение инспекции в суде (дело № А69-2172/2015), представив после составления акта выездной проверки (в 2014 году) уведомление об освобождении от уплаты НДС, указывая на пункт 1 статьи 145 НК – выручка от аренды не превысила 2 млн рублей.
Суды трех инстанций частично удовлетворили требования истца, указав, что лицам, фактически использовавшим в соответствующих налоговых периодах освобождение от исполнения обязанностей налогоплательщика, не может быть отказано в праве на такое освобождение со ссылкой на нарушение срока представления уведомления.
Однако, суды установили, что в 1, 2, 3 кварталов 2011 года, а также 1 квартала 2012 года компания выставляла счета-фактуры с выделенной суммой налога, исчисляла и уплачивала НДС, фактически заявила о наличии обязанности по уплате НДС посредством подачи налоговых деклараций. Следовательно, до 1 квартала 2012 года выручка от аренды подлежит обложению НДС, указали суды (постановление кассации Ф02-4348/2016, Ф02-4354/2016 от 29.09.2016).
