ООО «С», применяющее УСН, представило в налоговый орган декларацию по НДС за 4 квартал 2011 года, в которой сумма налога, исчисленная с налоговой базы, составила 42,02 млн рублей, сумма вычетов - 41,98 млн рублей, сумма налога к уплате в бюджет равна 48 тысячам рублей.

При этом ООО «С» считает, что утратило право на УСН в указанном периоде, поскольку превысило лимит остаточной стоимости основных средств. Кроме того, доля участия в ООО «С» другой организации (ЗАО) превысила 25%.

Объектом налогообложения по НДС явилась реализация недвижимого имущества за 275,5 млн рублей в адрес ООО «Ю», а вычет связан с выполнением подрядчиками ремонтных работ и услуг, общая стоимость которых составила 275,1 млн рублей.

По результатам камеральной проверки инспекция отказала в налоговых вычетах и привлекла компанию к ответственности за неуплату НДС в размере 41,98 млн рублей, доначислила НДС и пени. Так как компания, не являясь плательщиком НДС, выставила счет-фактуру с выделенной суммой налога, она должна ее перечислить в бюджет.

Суды трех инстанций (дело № А75-8692/2012), соглашаясь с налоговиками, решили, что у компании не было оснований для перехода на общий режим в 4 квартале 2011 года.

Суды разъясняют, что при продаже доли в уставном капитале подтверждающие документы должны быть представлены в регистрирующий орган в течение месяца со дня принятия решения о распределении доли или части доли между участниками. Изменения вступают в силу только с момента госрегистрации. В данном случае регистрация перехода доли в ООО «С» к ЗАО произведена 3 февраля 2012 года, значит, основания для перехода на общий режим в 4 квартале 2011 года у ООО отсутствовали.

Также теряют право на применение УСН компании, у которых остаточная стоимость основных средств и нематериальных активов превышает 100 млн рублей. Довод компании о потере права на УСН по этой причине также отклонен судами, ввиду ее документальной неподтвержденности.

Имущество, проданное в спорном периоде, исходя из представленной копии договора купли-продажи, было приобретено компанией в июле 2009 года. Однако документ был оценен судами критически, подлинник договора компания не представила. Оплата этого имущества также документально не подтверждена.

Из представленных компанией документов инспекция определила остаточную (по данным бухучета) стоимость основных средств по состоянию на 1 октября 2011 года, которая составила 78 млн рублей, что не опровегается данными, полученными от Росреестра. Так что, несмотря на продажу недвижимости на сумму 275,5 млн рублей, в 4 квартале 2011 года ООО «С» не утратило право на применение УСН и по этому основанию. 

В деле не упоминается о превышении лимита доходов, которое связано с продажей имущества, как о еще одном возможном основании для утраты права фирмы на УСН. Причины можно только предположить:

  • проверка была камеральная, а декларация - по НДС, и инспекция не проверяла доходы компании, а отказывала в вычетах;
  • компания сама в заявлении не указала превышение суммы доходов в качестве причины отказа от УСН;
  • суды сочли документально не подтвержденной сделку по купле спорной недвижимости, не исключено, что подвергли сомнению и ее продажу, несмотря на наличие базы по НДС согласно счету-фактуре.