В письме от 18 ноября 2013 г. N 03-07-14/49507 Минфин напомнил правило для принятия к вычету НДС - если приобретаемые услуги или товары в дальнейшем используются в являющихся объектами обложения НДС операциях. Если приобретенные товары не используются налогоплательщиком для операций, подлежащих налогообложению, то оснований для принятия к вычету сумм налога, предъявленных при их приобретении, не имеется.

С учетом этого, по мнению Минфина, ИП, прекращающему предпринимательскую деятельность, следует представить в налоговый орган уточненные декларации по НДС. Это относится к тем налоговым периодам, в которых входящий НДС принят к вычету по товарам, остающимся в собственности физлица после прекращения им предпринимательской деятельности. Следует уменьшить вычеты на суммы налога по таким товарам в соответствующей доле, в частности, с остаточной стоимости основных средств.