Если организация подала документы на получение разрешения (лицензии) и на их основании вынесен мотивированный отказ в его выдаче, то уплаченная госпошлина не возвращается.Такое предупреждение содержится в письме ФНС России от 02.09.13 № ММВ-18-15/970.

Порядок возврата уплаченной суммы государственной пошлины за совершение юридически значимых действий определен в статье 333.40 Налогового кодекса. Этой же нормой установлено, что госпошлину, уплаченную за выдачу лицензии, можно вернуть в двух случаях:

  • пошлина уплачена в большем размере, чем это определено в НК РФ (подп. 1 п. 1 ст. 333.40 НК РФ);
  • лицо, уплатившее госпошлину, отказывается от совершения юридически значимых действий до обращения в уполномоченный орган (подп. 4 п. 1 ст. 333.40 НК РФ).

Таким образом, по мнению ФНС, если лицо уплатило госпошлину, но в дальнейшем не обратилось в уполномоченный орган за выдачей разрешения (лицензии), то сумма госпошлины возвращается. Если же документы на получение разрешения (лицензии) были поданы и на их основании вынесен мотивированный отказ в выдаче разрешения (лицензии), то уплаченная госпошлина заявителю не возвращается.