В соответствии с письмом Минфина РФ от 03.04.2007 г. № 03-07-09/3, при отгрузке возвращаемых товаров, принятых на учет, покупатель обязан в порядке, установленном п. 3 ст. 168 НК РФ, выставить продавцу этих товаров соответствующий счет-фактуру, также зарегистрировать в книге продаж второй экземпляр счета-фактуры.

При расхождении количества и стоимости товаров, указанных в счете-фактуре, с фактическим количеством и стоимостью реализованных товаров продавец может внести в счет-фактуру исправления, заверенные подписью руководителя и печатью продавца, с указанием даты внесения исправления, пишет klerk.ru.