Если организация состоит на учете в налоговом органе в качестве плательщика единого налога в муниципальном образовании и открывает новые обособленные подразделения (магазины) в том же муниципальном образовании, то исчисление суммы ЕНВД должно производиться в соответствии с пунктом 9 статьи 346.29 НК РФ.

Если организация состоит на учете в качестве плательщика ЕНВД в одном муниципальном образовании и открывает новые обособленные подразделения (магазины) в другом муниципальном образовании, где становится на учет в качестве "вмененщика", то исчисление суммы единого налога по этим новым магазинам должно производиться согласно абзацу 3 пункта 10 статьи 346.29 НК РФ.

Подобный вывод содержится в письме Минфина России от 23.05.2013 № 03-11-06/3/18486.