При заявительном порядке возмещения НДС налогоплательщик предоставляет банковскую гарантию, отвечающую требованиям п.6 ст. 176.1 НК. Среди прочего, там указано: "сумма, на которую выдана банковская гарантия, должна обеспечивать исполнение обязательств по возврату в бюджет в полном объеме суммы налога, заявляемой к возмещению".
Несмотря на это, в письме от 26.09.12 № 03-07-15/127 Минфин сделал вывод: представление в налоговые органы банковской гарантии на часть суммы налога, заявленной к возмещению в декларации по НДС и указанной в заявлении о применении заявительного порядка возмещения налога, представляемом с данной декларацией, действующим нормам НК не противоречит.
Предпосылки в такому выводу, согласно письму: во-первых, в заявлении налогоплательщик берет на себя обязательства вернуть излишне возмещенный налог, а во-вторых, решение о возмещении НДС может быть впоследствии отменено не только полностью, но и частично.
