Если компания платит за съемную квартиру для работника, то с него надо взять НДФЛ. Так не раз сообщали чиновники (письмо Минфина России от 17.01.11 № 03-04-06/6-1 и др.) У судей иное мнение. Пример - постановление ФАС Уральского округа от 08.06.12 № Ф09-3304/12.

Средства, как отметил арбитраж, не выдавались сотрудникам. Они сразу перечислены арендодателем. Сама оплата необходима для привлечения иногородних специалистов. В первую очередь, она произведена в интересах организации, а не физлица. Если выплата не в интересах физлица, то нет и базы по НДФЛ. Это ясно из пункта 2 статьи 211 НК РФ.

Доказать отсутствие налоговой базы можно только в суде. Там дополнительно надо обращаться к статье 169 ТК РФ. Она прописывает компенсацию при переезде на работу в другую местность. Ее величина закрепляется в трудовом договоре, где можно предусмотреть наем жилья для сотрудника. Тогда расходы на оплату проживания включаются в компенсацию, связанную с исполнением трудовых обязанностей. Подобная сумма освобождена от НДФЛ. Основание - пункт 3 статьи 217 НК РФ, о котором не раз напоминал арбитраж. Сошлемся хотя бы на постановления ФАС Московского округа от 21.03.11 № КА-А40/1449-11 и ФАС Поволжского округа от 15.11.11 № А12-1987/2011.